摘要：目的 对不产色链霉菌(Streptomyces achromogenes var. Streptozoticus)NRRL 3125次级代谢产物的生物合成基因簇进行系统分析，并利用培养条件优化和基因敲除，证实该菌株是1株新的草铵膦三肽生产菌。方法 首先，利用antiSMASH等生物信息学工具对链霉菌NRRL 3125的基因组进行分析与注释，结合NCBI数据库对蛋白进行功能预测与分析，提示菌株次级代谢产物多样性，为挖掘活性天然产物提供理论指导。其次，通过序列同源性比对以定位目标基因簇，通过优化培养条件以激活该基因簇，并运用基因敲除和液相色谱-质谱联用(LC-MS)检测技术对目标基因簇的产物进行确定。结果 不产色链霉菌NRRL 3125基因组中含有一条与已知草铵膦三肽的生物合成基因簇高度相似的基因簇，二者的开放阅读框具相同的组织排列方式，并且编码的蛋白具有59%~96%的同源性，特定培养条件可以激活该基因簇的表达。对基因簇中3个结构基因进行敲除并发酵验证，证实了该基因簇与草铵膦三肽生物合成相关，说明链霉菌NRRL 3125是一株新的含磷化合物生产菌。结论 链霉菌(Streptomyces achromogenes var. Streptozoticus NRRL 3125)基因组中存在丰富的次级代谢产物生物合成基因簇，利用生物信息学工具对其进行系统分析，可以为目标分子的获取提供高效且科学的指导，为挖掘具有良好生物活性的天然产物提供参考。

摘要：核糖体合成和翻译后修饰肽(核糖体肽)是一大类天然产物，具有丰富的化学结构及多样的生物活性。核糖体肽这些特性的关键物质基础是多样性的多肽序列及广泛的翻译后修饰引入的各种官能团。在核糖体肽的众多生物活性中，抗菌活性是被广泛关注的一种。核糖体肽独特的抗菌机制和较低的耐药性风险使其成为抗菌药物研发的重要方向。本文梳理了具有抗菌活性的核糖体肽，并简要介绍了其分类、结构特征、生物合成机制以及抗菌机制，旨在为新型抗菌药物的研发提供理论依据和指导。

摘要：目的 在丝状真菌构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中异源生产绿僵菌素类化合物，为建立绿色高效的生物合成方法奠定基础。方法 在罗伯茨绿僵菌(Metarhizium robertsii)基因组中PCR扩增绿僵菌素生物合成基因dtxS1和dtxS2的DNA序列，利用酵母组装法构建异源表达载体，通过PEG介导的原生质体转化法将载体导入构巢曲霉LO8030底盘菌中。利用乙酸乙酯萃取转化子培养物并获得粗提物，利用LC-MS确定绿僵菌素类化合物的分子量。结果 参与绿僵菌素生物合成的非核糖体多肽合成酶基因dtxS1和细胞色素P450基因dtxS2可以直接在丝状真菌构巢曲霉底盘菌中异源表达。由于底盘菌中存在绿僵菌素生物合成基因簇中dtxS3和dtxS4的同源序列，故仅表达dtxS1和dtxS2就能产生绿僵菌素类化合物，且其种类多于罗伯茨绿僵菌野生型产生的。结论 丝状真菌构巢曲霉可成功异源表达绿僵菌素生物合成基因dtxS1和dtxS2，并产生一系列绿僵菌素类化合物。

摘要：青霉素的发现开启了抗生素时代，改变了对感染性疾病的治疗方式，提高了人类的生存质量。然而随着抗生素的大量使用，耐药菌日益增多，出现了“超级细菌”等危机，但目前临床中能够有效抑制耐药菌的抗生素为数不多，亟须开发新型抗生素。抗生素发现的传统方法效率低下，难以高效发现潜在的新型抗生素分子，而多组学、合成生物学和人工智能等交叉学科的发展则为挖掘和设计新型抗生素分子带来了新的契机。本文综述了近10年新型抗生素分子的挖掘与设计所取得的研究进展，旨在为新型抗生素的创制提供借鉴。

摘要：Cyclopiane二萜是一类具有高度拥挤顺式-顺式-顺式6/5/5/5稠合四环结构骨架，并且至少含有6个连续手性中心的天然产物，目前该类二萜主要从海洋来源的青霉菌中分离鉴定。到目前为止已鉴定了30个cyclopiane二萜天然产物，其主要区别在于母核骨架中A，B或D环中具有不同的氧化修饰。另外，初步的活性测试表明cyclopiane二萜具有潜在的诱导分生孢子产生，细胞毒，抗菌，抗炎和抗过敏等活性。其新颖复杂的结构骨架和显著的生物活性吸引了来自天然产物各研究领域学者的关注。本文主要总结了cyclopiane类二萜天然产物的分离鉴定及其生物活性，同时对其化学全合成以及生物合成进行了介绍。最后，通过目前发现的与cyclopiane类二萜在环化过程中具有相关性的其他类型的二萜天然产物，对相关环化酶产生多样性骨架进行了讨论，并展望了基于基因组信息进行多样性萜环化酶挖掘的潜力。

摘要：药用真菌因其独特的疗效和深远的历史在中医药中占据着举足轻重的地位。然而，野生药用真菌由于对特定生态环境的依赖，资源稀缺，限制了其开发和利用。合成生物学技术通过构建微生物细胞工厂，实现活性成分的绿色高效合成，为珍稀药用真菌活性成分的可持续利用开发提供了新的途径。本文综述了近年来药用真菌活性成分异源微生物合成方面的研究进展，并探讨了基因组挖掘与异源生物合成技术结合在新药效物质发掘方面的潜力，旨在为药用真菌资源的开发和利用提供科学依据。